雖然二氧化氯(ClO)和次氯酸鈉(NaClO)都屬于主流的消毒產品，但其中的區別還是蠻大的，不管從安全性、消毒效果好還是使用成本上，次氯酸鈉更勝一籌！ 我們都知道次氯酸鈉屬于強堿弱酸鹽，清澈透明，它是一種能*溶解于水的液體。但由于次氯酸鈉液不易久存，次氯酸鈉多以電解低濃度食鹽水現場制備。
就消毒而言，次氯酸鈉液還是具有明顯優勢的。作為一種真正高效、廣譜、安全的強力滅菌、殺病毒劑，它同水的親和性很好，能與水任意比互溶，它不存在液氯、二氧化氯等藥劑的安全隱患，且其消毒效果被*為和氯氣相當加之其投加準確，操作安全，使用方便，易于儲存，對環境無毒害，不存在跑氣泄漏，故可以在任意環境工作狀況下投加。
在殺菌、殺病毒過程中，不僅可作用于細胞壁、病毒外殼，而且因次氯酸分子小，不帶電荷，可滲透入菌（病毒）體內與菌（病毒）體蛋白、核酸、和酶等發生氧化反應，從而殺死病原微生物。
次氯酸鈉采用電解稀鹽水制取次氯酸鈉溶液，不需要任何其他的添加物，設備的原材料就是鹽，設備全自動運行，人工成本低。
然后我們再來說說二氧化氯，二氧化氯是一種極活潑的化合物，稍經受熱，就會迅速而爆炸性分解為氯氣和氧氣。因此具有比氯氣更大的刺激性和毒性。二氧化氯極其不穩定，不能象次氯酸鈉那樣可以運輸，運輸中很容易發生爆炸事故，所以只有依靠現場制備。
由于制取二氧化氯需要使用氯酸鈉或者KClO3，所以運行成本很高，大約為次氯酸鈉運行成本的5倍以上。此外，由于鹽酸容易揮發，并具有強烈腐蝕性，因此，在管理上相對比較麻煩，需要較多的安全容器來儲存保管。
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